1、根据施用方法选择。如果用于冲洗、滴灌或叶面喷洒，建议使用腐植酸钾、腐植酸铵或黄腐酸铵。如果用作基肥，建议选择腐植酸铵或硝基腐植酸铵等肥料，施用时注意将其埋入土壤中，因为腐植酸铵是腐植酸和碳酸氢铵的结合产物，容易挥发，不建议洗施或喷叶。此外，不要在pH值较高的土壤（盐渍土）中施用腐植酸钠。

2、根据农作物喜好和生长节选择。比如种植户种植的是果树，那么秋季施磷钾肥，春季施氮肥，发芽分化施磷钾肥，氮肥、钾肥、钙肥和微肥在果实膨大期施用。另外，施肥要结合作物的喜好，例如果树、茄科果蔬、烟草、甘蔗等都是喜钾作物，以腐植酸钾肥效果较好。

3、根据农作物种类和预算选择。腐植酸肥料按养分种类和数量可分为腐植酸单质肥料、腐植酸复合（混）肥、腐植酸有机肥、腐植酸有机无机复合肥和微量元素腐植酸肥。

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